В стандартной комплектации отсутствуют фильтры тонкой очистки, благодаря которым улавливается самая мелкая пыль, дым от сигарет, пыльца растений и многие запахи. Подобные очистители изготавливаются на основе активированного угля, выработанного из кокосовых орехов, и называются дезодорирующими или карбоновыми (угольными).

В зависимости от условий эксплуатации фильтра тонкой очистки, он будет сохранять свою улавливающую способность определенный промежуток времени. В условиях крупных мегаполисов, такие очистители не могут служить более трех-четырех месяцев, и, как правило, выбрасываются, отслужив свой срок, поскольку в них накапливаются микробы.

Исключением являются цеолитные или фотокаталитические фильтры, обладающие способностью к частичному восстановлению под воздействием ультрафиолетовых лучей, и позволяющие многократную эксплуатацию. Не следует забывать, что при сильной степени загрязнения воздуха, использование специального воздухоочистителя, будет намного целесообразнее и выгоднее. 

Фильтр-плазма представляет собой плазменный ионизатор, который создает поле напряжением в 4800 вольт, что позволяет полностью уничтожить любое органическое соединение, попавшее в кондиционер. Это могут быть споры грибков, вирусы, микроскопические микробы или пыльца растений.

Пыль для таких очистителей является крупным соединением, поэтому она ионизируется и прилипает к фотокаталитическому фильтру, который способен также частично разряжать воздух, прошедший процесс ионизации при проникновении через «Плазму». Такая система очистки может использоваться неограниченное время, и не требует периодической замены элементов, что делает её применение экономически выгодным. 

Разработкой, запатентованной компанией Panasonic, является электростатический фильтр, оснащенный катехиновым покрытием. Катехин является мощнейшим антисептиком природного происхождения, который содержится в ряде растений, в том числе, в чайных листьях.

В ходе экспериментов удалось выяснить, что вирусы, прошедшие обработку таким очистителем, в 98 процентах случаев через шесть часов были обезврежены, не представляя опасности для человека. Компанией Samsung в 2003 году была также разработана модель катехинового фильтра. 

Фирма Fujitsu General предложила патентованную разработку электростатического фильтра, обработанного веществом, полученным из японского хрена «васаби», который слывет сильнейшим антисептиком и издавна используется в народной медицине. 

Фотокаталитический или цеолитный угольный фильтр, обладает высокой поглощающей способностью, но не требует периодической замены, в отличие от своих аналогов. Если такой очиститель начинает плохо работать, его в течение нескольких часов выдерживают под прямыми лучами солнца, и он на 95 процентов восстанавливает свои возможности. 

Кондиционеры Samsung с «антибактериальной формулой», предлагают наличие предфильтра, где крупные пылевые частицы проходят антибактериальную обработку, биодеодорирующего очистителя, который уничтожает неприятные запахи, воздушного биофильтра, где задерживаются микроорганизмы и микроскопическая пыль. После прохождения такой системы очистки, воздух попадает в теплообменник, который обработан антибактерицидным и противоплесневым составом, после чего поступает к вентилятору.